1360547-55-2,6-HEX Phosphoramidite,HEX亚磷酰胺6-异构体,分子结构有哪些优势? ypxx.net

一、理论分析:

中文名:HEX亚磷酰胺6-异构体

英文名:6-HEX Phosphoramidite,HEX phosphoramidite, 6-isomer

CAS号:1360547-55-2

化学式:C46H52Cl6N3O10P

分子量:1050.61

二、产品详情:

供应商:陕西新研博美生物科技有限公司

规格:1mg、5mg、10mg

货期:根据具体的产品而定

纯度:95%

用途:实验用途,科学研发,可定制服务

注意事项:所有的试剂不可用于临床,不可用于食用,人体。

操作要点:工作浓度建议优化为 1–10 μmol/L,反应体系需保持pH稳定,储存时应避光、密封于 -20°C,DMSO储备液可稳定保存 6个月以上,并现配现用以确保活性。

三、结构式:

四、6-HEX Phosphoramidite分子结构有哪些优势

6-HEX Phosphoramidite的分子结构具有以下显著优势,这些优势使其在寡核苷酸合成及荧光标记领域得到广泛应用:

1.六氯荧光素(HEX)荧光团:

高荧光强度与稳定性:HEX荧光团是一种经过化学改良的荧光染料,具有高荧光量子产率(约0.92),能够产生明亮且稳定的荧光信号。其激发波长约为535纳米,发射波长约为556纳米,属于橙黄色荧光区,易于在光谱中识别和区分。

光稳定性增强:六氯修饰显著提升了荧光团的光稳定性,减少了荧光淬灭,适合长时间成像和反复激发的实验需求。

2.六碳烷基链(Hexyl Linker):

空间隔离效应:六碳烷基链作为连接臂,将荧光团与寡核苷酸骨架分隔开,降低了标记基团对核酸结构和功能的干扰。这种空间隔离有助于保持寡核苷酸的二级结构和配对稳定性,提高标记的准确性和可靠性。

灵活性增强:六碳链的长度和柔性为荧光团提供了更大的自由度,使其在合成后能够保持最佳的光学性能,同时减少对寡核苷酸生物活性的影响。

3.活性亚磷酰胺基团(Phosphoramidite Core):

高反应活性:亚磷酰胺基团是寡核苷酸固相合成的标准活性基团,能够与核苷酸5'-羟基端发生高效、可控的磷酰胺化反应,形成稳定的磷酸二酯键。这一特性使得6-HEX Phosphoramidite能够轻松引入到寡核苷酸链的特定位点。

合成兼容性:活性亚磷酰胺基团与自动化固相合成技术兼容,支持在DNA或RNA链的5'端、内部或3'端进行精确标记,满足多样化的实验需求。

4.保护基设计(如DMT):

定向偶联保障:5'-端通常含有二甲氧基三苯甲基(DMT)保护基,确保在固相合成过程中荧光标记的定向偶联,避免副反应的发生,提高标记效率和寡核苷酸的纯度。

化学选择性提升:保护基的存在保证了化学选择性,在多步合成过程中防止不必要的副反应,确保标记位置和数量的精确控制。

五、相关试剂产品:

FAM Phosphoramidite,5-isomer,6-FAM-Phosphoramidite

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