
核酸适配体(Aptamer)属于单链 DNA 或 RNA 分子,依靠自身折叠形成独特的空间构象,能够结合蛋白、多肽、小分子以及完整细胞等各类靶标。对比传统抗体,适配体依靠化学方式合成,修饰改造灵活,储存稳定性良好,在生物分析、靶向传感等领域应用广泛。SELEX 体外分子进化技术是开发适配体的主流方式,整套流程包含文库制备、多轮筛选、序列分析与活性验证,实验过程中也存在不少需要留意的细节。

核酸文库合成的关键细节
文库质量会直接影响筛选的成败,随机文库一般采用两端保守引物序列搭配中间随机碱基片段的模块化设计。DNA 适配体固相合成工艺成熟,抗核酸酶降解,更适合多数体外检测实验;RNA 适配体构象更加丰富,对部分小分子靶标识别效果较好,但转录制备流程相对繁琐。文库合成结束后需要完成纯化质控,去除残缺片段与杂质,保障文库整体均一。
SELEX 筛选的完整实验流程
SELEX 依靠多轮循环完成特异性序列富集。先对文库进行变性复性处理,让核酸充分折叠;再和靶标分子恒温孵育完成结合;通过梯度洗涤去掉游离以及弱结合的核酸;回收目标序列后进行 PCR 扩增,生成次级文库进入下一轮筛选。多轮筛选完成达到富集饱和,利用高通量测序解析优势序列,再开展亲和力与特异性验证,得到功能性适配体。
各类 SELEX 体系的适用场景
传统 SELEX 存在周期偏长、背景干扰较高的问题,衍生出多种改良方案。磁珠偶联 SELEX 适合蛋白、多肽类固相靶标;细胞 SELEX 面向活细胞样本,用于筛选细胞膜适配体;HT‑SELEX 结合高通量测序,压缩研发周期,适配批量筛选,科研人员可以结合靶标类型灵活选用。
实操中高频遇到的实验难题
实验常会遇到假阳性占比高、适配体活性不达预期的问题。增设阴性筛选、优化洗涤条件,能够减少假阳性干扰;筛选得到的全长序列带有冗余碱基,通过序列截短、定点修饰精简核心结合区,可改善适配体的结合性能。小分子、易降解蛋白这类靶标筛选难度更高,需要调整实验条件。
适配体研发链路长,变量复杂,文库质控、条件调试、活性验证都会左右实验结果。卡梅德生物可以提供定制核酸文库合成、多类型 SELEX 靶向筛选、序列生物信息分析、适配体修饰及亲和力验证相关技术服务,支撑科研人员开展适配体相关课题研究。












