卡梅德生物|SELEX 筛选,核酸适配体药物开发试验项目实践笔记(卡梅徳生物) ypxx.net

SELEX 是核酸适配体筛选的主流技术平台,通过体外迭代筛选从随机核酸文库中得到特异性靶标结合序列。不少科研人员在文库构建、筛选循环环节把控不到位,导致拿到的适配体亲和力、特异性达不到预期。本文梳理 SELEX 平台与适配体药物开发的实操要点,方便研发人员快速参考。

SELEX 技术基本原理

SELEX 核心是多轮 “结合‑分离‑洗脱‑扩增” 循环筛选。初始随机文库拥有大量核酸序列,能够形成多样化空间结构,可结合蛋白、小分子、细胞等不同靶标。经过 8‑12 轮筛选,逐步淘汰非特异性、低亲和力序列,富集优势候选序列,再结合高通量测序与活性验证完成候选分子筛选。

SELEX 平台主要模块

整套平台由文库构建、靶标孵育、分离洗脱、扩增再生、测序验证几大模块组成。文库分为 DNA 与 RNA 文库,需要保障文库多样性;针对蛋白、小分子、细胞靶标要做差异化预处理,同时设置阴性对照减少背景干扰;筛选完成后回收核酸序列,经过 PCR 扩增再生文库;多轮筛选结束后测序分析,开展亲和力、特异性验证,得到候选适配体。

SELEX 标准化筛选流程

正式筛选先完成靶标纯化、缓冲体系调试等前置准备;开展阴性筛选去除非特异结合序列;之后进行多轮阳性富集,逐步提高洗涤严苛程度;筛选结束后做序列鉴定,预测核酸二级结构;最后开展多维度功能验证,评估适配体的结合能力与生物活性,筛选适合药物开发的序列。

适配体药物开发与质控要点

相比抗体,适配体体外筛选不受动物个体影响,便于化学修饰。在筛选过程中需要平衡富集效率与序列多样性,规避 PCR 偏好扩增,做好内毒素、杂蛋白的质控。筛选得到的适配体可用于靶向拮抗、靶向递送、长效修饰等不同药物研发方向。

文库质量、筛选严谨度、后期活性验证共同决定适配体的开发潜力,卡梅德生物可以提供 SELEX 技术筛选、适配体序列优化、适配体药物前期研发相关技术服务。